0% Complete
English
صفحه اصلی
/
یازدهمین کنفرانس بین المللی فناوری اطلاعات و دانش
ParaKavosh: A Parallel Algorithm for Finding Biological Network Motifs
نویسندگان :
Zahra Razaghi Moghadam Kashani
1
Ali Masoudi-nejad
2
Abbas Nowzari-dalini
3
1- موسسه ماکس پلانک
2- دانشگاه تهران
3- دانشگاه تهران
کلمات کلیدی :
Network Motifs, Bioinformatics, Parallel Algorithms
چکیده :
Biological networks have recently gathered much attraction in finding their motifs, which are small connected sub-graphs that occur significantly in higher frequencies than in random networks. They are useful concept to uncover structural design principles of complex networks. The importance of this problem causes attention of improving the existing algorithms. As the running time of an algorithm is an important aspect, applying parallel techniques is appropriate for better improvement. In this paper we present a parallel algorithm (ParaKavosh) for finding motifs. We evaluated our algorithm on biological networks of E. coli, S. cerevisiae, Homo sapiens and Rattus norvegicus. The optimality of our algorithm is demonstrated by comparing the obtained results with an efficient sequential algorithm. The results show that our algorithm performs much better in terms of running time.
لیست مقالات
لیست مقالات بایگانی شده
جانمایی توزیعشده محتوا برای ذخیرهسازی موقت در شبکههای سلولی کوچک با حضور کاربران مخرب
زهرا رشیدی - دکتر وصال حکمی - حانیه سلمانطاهری زهرا رشیدی - وصال حکمی - حانیه سلمانطاهری -
Improving Drug-Target Interaction Prediction Using Enhanced Feature Selection
Maryam Taheri - Mohammad Reza Keyvanpour - Mohadeseh Saadat Mousavi
IT-based and Non-IT-based methods to separate and collect waste
Hoda Harati - Farzad Haghighi-Rad - Reza Yousefi Zenouz
طراحی و بهینه سازی زنجیره تأمین پلت چوبی از ضایعات چوب در ایران
فاضل حاجی زاده ابراهیمی - نجمه محمودی - احسان حیدریان فروشانی
Predictive Maintenance using LSTM and Adaptive Windowing
Aien Ghanbari Adivi - Behrouz Shahgholi Ghahfarokhi
پیش بینی گره های رهبر در شبکه های اجتماعی با استفاده از پیش بینی پیوند
روح اله رشیدی - فرساد زمانی بروجنی - محمد رضا سلطان آقایی - هادی فرهادی
A Novel Approach to Data mining algorithms and IoT based data mining machine learning
Danial Ramezani - Seyed Hossein Siadat
Architectural Insights: Comparing Weight Stationary and Output Stationary Systolic Arrays for Efficient Computation
Mahdi Kalbasi
Beyond One-Hot: CatBoost for Heating and Cooling Load Prediction
Shayan Naghizadeh - Mohammad Saeed Rajabi - Ehsan Nazerfard
Detection and Identification of Cyber-Attacks in Cyber-Physical Systems Based on Machine Learning Methods
Zohre Nasiri Zarandi
بیشتر
ثمین همایش، سامانه مدیریت کنفرانس ها و جشنواره ها - نگارش 44.5.0
