کنفرانس بین المللی فناوری اطلاعات و دانش

English

صفحه اصلی / یازدهمین کنفرانس بین المللی فناوری اطلاعات و دانش

ParaKavosh: A Parallel Algorithm for Finding Biological Network Motifs

نویسندگان :

Zahra Razaghi Moghadam Kashani¹ Ali Masoudi-nejad² Abbas Nowzari-dalini³

1- موسسه ماکس پلانک 2- دانشگاه تهران 3- دانشگاه تهران

کلمات کلیدی :

Network Motifs, Bioinformatics, Parallel Algorithms

چکیده :

Biological networks have recently gathered much attraction in finding their motifs, which are small connected sub-graphs that occur significantly in higher frequencies than in random networks. They are useful concept to uncover structural design principles of complex networks. The importance of this problem causes attention of improving the existing algorithms. As the running time of an algorithm is an important aspect, applying parallel techniques is appropriate for better improvement. In this paper we present a parallel algorithm (ParaKavosh) for finding motifs. We evaluated our algorithm on biological networks of E. coli, S. cerevisiae, Homo sapiens and Rattus norvegicus. The optimality of our algorithm is demonstrated by comparing the obtained results with an efficient sequential algorithm. The results show that our algorithm performs much better in terms of running time.

لیست مقالات

لیست مقالات بایگانی شده

Designing an AI-assisted toolbox for fitness activity recognition based on deep CNN

Ali Bidaran - Dr Saeed Sharifian

Embedded speech encoder for low-resource languages

Alireza A.Tabatabaei - Pouria Sameti - Ali Bohlooli

توسعه ی کارآفرینی دیجیتال در بخش کشاورزی

شایان مظاهری - فاطمه قربانی پیرعلیدهی - فاطمه رزاقی بورخانی

SDN-based Deep Anomaly Detection For Securing Cloud Gaming Servers

Mohammadreza Ghafari - Dr Seyed Mostafa Safavi Hemami

Vi-Net: A Deep Violent Flow Network for Violence Detection in Video Sequences

Tahereh Zarrat Ehsan - Seyed Mehdi Mohtavipour

توسعه مدل مفهومی طراحی فرآیند مدیریت بحران سیلاب از طریق بهینه سازی استفاده از دستگاه های اینترنت اشیاء (IoT Devices) در تصمیم گیری

محمود رسولی - سید احسان ملیحی

استخراج ویژگی مجموعه داده‌های پزشکی دارای ابعاد بالا با استفاده از برنامه نویسی ژنتیک چند منظوره

سحر فقیهی راد - دکتر سیده نفیسه آل محمد سحر فقیهی راد - سیده نفیسه آل محمد -

Information Technology Risk Management Model for Remote Control Vehicles

Hamid Reza Naji - Aref Ayati

Enhancing Employee Promotion Prediction with a Novel Hybrid Model Integrating Convolutional Neural Networks and Random Forest

Pouya Ardehkhani - Seyyed Reza Moslemi - Hanieh Hooshmand

بررسی تأثیر استقرار استاندارد COBIT در افزایش بهره وری سازمان‌ها (مطالعه موردی: شعب نمایندگی‌های همراه اول، ایرانسل، رایتل)

دکتر محمد ابراهیم سمیع - ساره رحمانیان محمد ابراهیم سمیع - ساره رحمانیان -

بیشتر

ثمین همایش، سامانه مدیریت کنفرانس ها و جشنواره ها - نگارش 42.2.4