کنفرانس بین المللی فناوری اطلاعات و دانش

English

صفحه اصلی / یازدهمین کنفرانس بین المللی فناوری اطلاعات و دانش

ParaKavosh: A Parallel Algorithm for Finding Biological Network Motifs

نویسندگان :

Zahra Razaghi Moghadam Kashani¹ Ali Masoudi-nejad² Abbas Nowzari-dalini³

1- موسسه ماکس پلانک 2- دانشگاه تهران 3- دانشگاه تهران

کلمات کلیدی :

Network Motifs, Bioinformatics, Parallel Algorithms

چکیده :

Biological networks have recently gathered much attraction in finding their motifs, which are small connected sub-graphs that occur significantly in higher frequencies than in random networks. They are useful concept to uncover structural design principles of complex networks. The importance of this problem causes attention of improving the existing algorithms. As the running time of an algorithm is an important aspect, applying parallel techniques is appropriate for better improvement. In this paper we present a parallel algorithm (ParaKavosh) for finding motifs. We evaluated our algorithm on biological networks of E. coli, S. cerevisiae, Homo sapiens and Rattus norvegicus. The optimality of our algorithm is demonstrated by comparing the obtained results with an efficient sequential algorithm. The results show that our algorithm performs much better in terms of running time.

لیست مقالات

لیست مقالات بایگانی شده

A No-Code Platform for Developing Customizable Recommender Systems for Restaurants

Moein-Aldin AliHosseini - MohammadReza Sharbaf

بررسی روش یادگیری انتقالی جهت پیش‌بینی پیوند

علی روحانی فر - کمال میرزایی بدرآبادی

دسته‌بندی متون خبری فارسی با یادگیری فعال

مینا طباطبائی - دکتر سعیده ممتازی

پیش بینی ارتباط میزان مرگ و میر با هم زمانی وجود دو بیماری در مبتلایان به کرونا به کمک بگارگیری شبکه عصبی Word2Vec

سمن مثقالی - دکتر جواد عسکری سمن مثقالی - جواد عسکری -

تخلیه‌ی باری وظایف اینترنت اشیاء بر روی مه محاسباتی با استفاده از الگوریتم حشره آبسوار

عفت تقی زاده بیلندی - آرش دلداری - علیرضا صالحان

Multi-label Classification of Steel Surface Defects Using Transfer Learning and Vision Transformer

Amirhossein Komijani - Farzaneh Vafaeinezhad - Javad Khoramdel - Yasamin Borhani - Esmaeil Najafi

استخراج ویژگی مجموعه داده‌های پزشکی دارای ابعاد بالا با استفاده از برنامه نویسی ژنتیک چند منظوره

سحر فقیهی راد - دکتر سیده نفیسه آل محمد سحر فقیهی راد - سیده نفیسه آل محمد -

شناسایی کمپلکس‎ های پروتئینی با استفاده از داده‎ های زیستی و خوشه بندی فازی

مریم مولی وردیخانی - دکتر سعید جلیلی مریم مولی وردیخانی - سعید جلیلی -

ارائه یک سیستم توصیه‌گر آگاه به زمینه مبتنی بر رفتار کاربر در شبکه اجتماعی با استفاده از پیام‌های برچسب شده جغرافیایی

زهرا امینی - سید علیرضا هاشمی گلپایگانی - علی میرزائی

Business Process Improvement Challenges: A Systematic Literature Review

Hanieh Kashfi - Fereidoon Shams Aliee

بیشتر

ثمین همایش، سامانه مدیریت کنفرانس ها و جشنواره ها - نگارش 42.3.1