0% Complete
English
صفحه اصلی
/
یازدهمین کنفرانس بین المللی فناوری اطلاعات و دانش
ParaKavosh: A Parallel Algorithm for Finding Biological Network Motifs
نویسندگان :
Zahra Razaghi Moghadam Kashani
1
Ali Masoudi-nejad
2
Abbas Nowzari-dalini
3
1- موسسه ماکس پلانک
2- دانشگاه تهران
3- دانشگاه تهران
کلمات کلیدی :
Network Motifs, Bioinformatics, Parallel Algorithms
چکیده :
Biological networks have recently gathered much attraction in finding their motifs, which are small connected sub-graphs that occur significantly in higher frequencies than in random networks. They are useful concept to uncover structural design principles of complex networks. The importance of this problem causes attention of improving the existing algorithms. As the running time of an algorithm is an important aspect, applying parallel techniques is appropriate for better improvement. In this paper we present a parallel algorithm (ParaKavosh) for finding motifs. We evaluated our algorithm on biological networks of E. coli, S. cerevisiae, Homo sapiens and Rattus norvegicus. The optimality of our algorithm is demonstrated by comparing the obtained results with an efficient sequential algorithm. The results show that our algorithm performs much better in terms of running time.
لیست مقالات
لیست مقالات بایگانی شده
تشخیص و جلوگیری از حمله انعکاسی/تقویتی SSDP در شبکه های نرم افزار محور مبتنی بر 4P با استفاده از الگوریتم های یادگیری ماشین
امیرحسین کرمی - رضا محمدی
Improving Long-Term Engagement of Insurance Brokerages by Providing Gamified Configurations Based on The Delphi Method
Hosein Bayati - Fattaneh Taghiyareh - Sahand Hashemi
A New Routing Protocol in Internet of Vehicles Inspired of Spread Model of the Covid-19 Virus
Taha Yasin Rezapour - Esmaeil Zeinali - Reza Ebrahimi Atani - Mohammad Mehdi Gilanian Sadeghi
خوشه بندی ویسیلاب های دو آوایی زبان فارسی در کاربرد لب خوانی
مهسا هدایتی پور - دکتر یاسر شکفته - دکتر محسن ابراهیمی مقدم
پیش بینی گره های رهبر در شبکه های اجتماعی با استفاده از پیش بینی پیوند
روح اله رشیدی - فرساد زمانی بروجنی - محمد رضا سلطان آقایی - هادی فرهادی
Generalized Self-Attentive Spatiotemporal GCN with OPTICS Clustering for Recommendation Systems
Saba Zolfaghari - Seyed Mohammad Hossein Hasheminejad
Silicon photonic microring resonators: A Novel optical router based on Negative-First routing algorithm
Negin Bagheri Renani - Elham Yaghoubi
یک روش خوشه بندی گره ها برای شبکه های حسگر بیسیم با هدف بهبود متوازن سازی بار مبتنی بر تکنیک تاپسیس
راضیه حسین رضایی - فهیمه یزدان پناه
بهبود هزینههای تراکنش در معماری مدیریت زنجیرهی تامین مبتنی بر زنجیرهی بلوکی
مژگان نوروزی نژاد - دکتر زهرا موحدی مژگان نوروزی نژاد - زهرا موحدی -
A Multi-Task Framework Using Mamba for Identity, Age, and Gender Classification from Hand Images
Amirabbas Rezasoltani - Alireza Hosseini - Ramin Toosi - MohammadAli Akhaee
بیشتر
ثمین همایش، سامانه مدیریت کنفرانس ها و جشنواره ها - نگارش 44.2.0
