0% Complete
English
صفحه اصلی
/
یازدهمین کنفرانس بین المللی فناوری اطلاعات و دانش
ParaKavosh: A Parallel Algorithm for Finding Biological Network Motifs
نویسندگان :
Zahra Razaghi Moghadam Kashani
1
Ali Masoudi-nejad
2
Abbas Nowzari-dalini
3
1- موسسه ماکس پلانک
2- دانشگاه تهران
3- دانشگاه تهران
کلمات کلیدی :
Network Motifs, Bioinformatics, Parallel Algorithms
چکیده :
Biological networks have recently gathered much attraction in finding their motifs, which are small connected sub-graphs that occur significantly in higher frequencies than in random networks. They are useful concept to uncover structural design principles of complex networks. The importance of this problem causes attention of improving the existing algorithms. As the running time of an algorithm is an important aspect, applying parallel techniques is appropriate for better improvement. In this paper we present a parallel algorithm (ParaKavosh) for finding motifs. We evaluated our algorithm on biological networks of E. coli, S. cerevisiae, Homo sapiens and Rattus norvegicus. The optimality of our algorithm is demonstrated by comparing the obtained results with an efficient sequential algorithm. The results show that our algorithm performs much better in terms of running time.
لیست مقالات
لیست مقالات بایگانی شده
Recommendation Systems in Smart Agriculture: Pathway to a well-designed system
Ahmad Nameni - Amir Ghafarian Daneshmand - Omid Mahdi Ebadati E
خوشهبندی موثر در استخراج توضیحات مفهوممحور خودکار برای شبکههای پیچشی
سعید معروف - مریم امیرمزلقانی - رضا صفابخش
Classification and Evaluation of Privacy Preserving Data Mining Methods
Negar Nasiri - Mohammadreza Keyvanpour
پیشبینی حجم ترافیک شهری با استفاده از دادههای سرویس نشان مورد مطالعاتی: خیابان کمال اصفهان
مهسا لطیفی - جمشید مالکی
AI-based Message Spam Classification Framework for Secure Autonomous Vehicles Communication
Riya Upadhyay - Mili Virani - Lakshit Pathak - Rajesh Gupta - Sudeep Tanwar - Hossein Shahinzadeh
Statistical distance-base acceptance strategy for desirable offers in bilateral automated negotiation
Arash Ebrahimnezhad - Dr Hamid Jazayeriy - Dr Faria Nassiri-mofakham
آرتمیا: پروتکل مسیریابی مبتنی بر انجمن و آگاه به نظم تماس در شبکة اجتماعی متحرک تأخیرپذیر
سعید مرادی - جمشید باقرزاده محاسفی
A Comparative Evaluation of Machine Learning Models for Anomaly-Based IDS in IoT Networks
Seyed Amir Mousavi - Mostafa Sadeghi - Mohammad Sadeq Sirjani
انتخاب ویژگی با استفاده از الگوریتم بهینه سازی ذرات مبتنی بر استراتژی خود تطبیقی دودویی جهت تشخیص بیماری
الهام صالحی - دکتر محمدرضا کرمی ملایی - دکتر حسام عمرانپور الهام صالحی - محمدرضا کرمی ملایی - حسام عمرانپور -
A Swarm Intelligence Approach to Design Optimal Repeaters in Multilayer Graphene Nanoribbon Interconnects
Majid Sanaeepur - Maryam Momeni
بیشتر
ثمین همایش، سامانه مدیریت کنفرانس ها و جشنواره ها - نگارش 44.5.0
