کنفرانس بین المللی فناوری اطلاعات و دانش

English

صفحه اصلی / یازدهمین کنفرانس بین المللی فناوری اطلاعات و دانش

ParaKavosh: A Parallel Algorithm for Finding Biological Network Motifs

نویسندگان :

Zahra Razaghi Moghadam Kashani¹ Ali Masoudi-nejad² Abbas Nowzari-dalini³

1- موسسه ماکس پلانک 2- دانشگاه تهران 3- دانشگاه تهران

کلمات کلیدی :

Network Motifs, Bioinformatics, Parallel Algorithms

چکیده :

Biological networks have recently gathered much attraction in finding their motifs, which are small connected sub-graphs that occur significantly in higher frequencies than in random networks. They are useful concept to uncover structural design principles of complex networks. The importance of this problem causes attention of improving the existing algorithms. As the running time of an algorithm is an important aspect, applying parallel techniques is appropriate for better improvement. In this paper we present a parallel algorithm (ParaKavosh) for finding motifs. We evaluated our algorithm on biological networks of E. coli, S. cerevisiae, Homo sapiens and Rattus norvegicus. The optimality of our algorithm is demonstrated by comparing the obtained results with an efficient sequential algorithm. The results show that our algorithm performs much better in terms of running time.

لیست مقالات

لیست مقالات بایگانی شده

شناسایی وبگاه های دام‌چینی به کمک شبکه عصبی گسسته‌ساز بردار یادگیر (LVQ)

یگانه ستاری - غلامعلی منتظر

طبقه بندی آسیبهای لیگامنت با استفاده از تحلیل تصاویر تشدید مغناطیسی توسط الگوریتمهای یادگیری عمیق

محسن اکبری - دکتر مریم مؤمنی محسن اکبری - مریم مؤمنی -

Using Deconvolutional Variational Autoencoder for Answer Selection in Community Question Answering

Golshan Afzali Boroujeni - Heshaam Faili

Persian deaf sign language recognition system using deep learning

Mohammad Ebrahimi

تشخیص مراحل خواب با کمک جنگل تصادفی و ویژگی های فرکانسی استخراج شده از سیگنال های EEG و EOG

سیدعلی حسینی

Revolutionizing Credit Scoring: The Synergy of Mamba State Space and CNN Models

Behnam Sabzalian

An LLM-Based Approach for Clarifying the Decisions of Vision Models in Autonomous Vehicles

Omid Mosalmani - Mohammad Javad Rashti - Seyed Enayat Alavi

کشف برخط تقلب پیشنهاد ساختگی (Bid-Shielding) در مناقصه و مزایده‌های الکترونیکی هلندی با رویکرد تحلیل شبکه اجتماعی

فاطمه الثلایا - دکتر سید علیرضا هاشمی گلپایگانی فاطمه الثلایا - سید علیرضا هاشمی گلپایگانی -

Real-Time EEG-Based Analysis Of Stress-Inducing Stimuli

Mohsen Mahmoudi - Fattaneh Taghiyareh - Yasamin Akhavein - Elnaz Ghorbani

سنجش داده محور ارزش ویژه برند کارکنان

علیرضا برادران - سپیده نصیری

بیشتر

ثمین همایش، سامانه مدیریت کنفرانس ها و جشنواره ها - نگارش 42.5.2