کنفرانس بین المللی فناوری اطلاعات و دانش

English

صفحه اصلی / یازدهمین کنفرانس بین المللی فناوری اطلاعات و دانش

ParaKavosh: A Parallel Algorithm for Finding Biological Network Motifs

نویسندگان :

Zahra Razaghi Moghadam Kashani¹ Ali Masoudi-nejad² Abbas Nowzari-dalini³

1- موسسه ماکس پلانک 2- دانشگاه تهران 3- دانشگاه تهران

کلمات کلیدی :

Network Motifs, Bioinformatics, Parallel Algorithms

چکیده :

Biological networks have recently gathered much attraction in finding their motifs, which are small connected sub-graphs that occur significantly in higher frequencies than in random networks. They are useful concept to uncover structural design principles of complex networks. The importance of this problem causes attention of improving the existing algorithms. As the running time of an algorithm is an important aspect, applying parallel techniques is appropriate for better improvement. In this paper we present a parallel algorithm (ParaKavosh) for finding motifs. We evaluated our algorithm on biological networks of E. coli, S. cerevisiae, Homo sapiens and Rattus norvegicus. The optimality of our algorithm is demonstrated by comparing the obtained results with an efficient sequential algorithm. The results show that our algorithm performs much better in terms of running time.

لیست مقالات

لیست مقالات بایگانی شده

ارائه یک رویکرد معنایی مبتنی بر آنتولوژی به منظور شناسایی تاکتیک‏های معماری

احسان شریفی - دکتر احمد عبدالله زاده بارفروش

Simulanteus Load Balancing of Servers and Controllers in SDN-based IoMT

Somaye Imanpour - Ahmadreza Montazerolghaem - Saeed Afahari

Effective Classifier for Predicting Churn in Payment Terminals Using RFM model and Deep Neural Network

Dr Mahila Dadfarnia - Ali Alemi Matinpour - Dr Monireh Abdoos

An Efficient Link Prediction Method using Community Structures

Dr Hadi Shakibian - Setareh Mokhtari

ParaKavosh: A Parallel Algorithm for Finding Biological Network Motifs

Dr Zahra Razaghi Moghadam Kashani - Dr Ali Masoudi-nejad - Dr Abbas Nowzari-dalini

‌نقشه های شناختی فازی پیشرفته (FCM) رویکردی برای مدل سازی سیستم های پیچیده ی پویا

فریبا اسلامی امیرآبادی - کمال میرزایی بدرآبادی

Classification of mental states of human concentration based on EEG signal

Mehran Safari Dehnavi - Vahid Safari Dehnavi - Dr Masoud Shafiee

An approach to model the optimal service provisioning in vehicular cloud networks

Farhoud Jafari Kaleibar - Maghsoud Abbaspour

بررسی امنیت وفقی در اینترنت وسایل نقلیه

سیده یگانه غیور باغبانی - دکتر سعید جلیلی سیده یگانه غیور باغبانی - سعید جلیلی -

A Novel Decentralized Privacy Preserving Federated Learning Model for Healthcare Applications

Saba Ameri - Reza Ebrahimi Atani

بیشتر

ثمین همایش، سامانه مدیریت کنفرانس ها و جشنواره ها - نگارش 41.3.1